Die älteste Aufzeichnung über Inzell ist von 959. In diesem Jahr wurde das Gebiet an der Traun dem Erzbischof von Salzburg übergeben.
Ob es zu der Zeit bereits eine Kirche gab, ist unbekannt - der Name "Cella interior" (innere Zelle) lässt darauf aber schließen. 1136 wurde die Gegend dem Augustiner-Chorherrenstift St. Zeno übergeben, deren Probst die romanische St. Michaels-Kirche erbaute.